Genomnetzwerk
Hämatologie

Resistenz gegenüber BCMA-gerichteter CAR T-Zell-Therapie

Anamnese

  • 41 Jahre alter Patient mit multiplem Myelom
  • Hochrisiko-Erkrankung (17p Deletion, Stadium R-ISS III)
  • Primär ungünstiger Verlauf mit unzureichendem Therapieansprechen auf Erstlinien-Therapie (Daratumumab/ Bortezomib/ Thalidomid/ Dexamethason = Dara-VTD), dann Erreichen einer Remission nach intensiver Chemotherapie + Carfilzomib (Kd-PACE) und Hochdosis-Chemotherapie mit Melphalan
  • Im Rezidiv Nachweis eines komplex-aberranten Karyotyps mit Monosomie 16 (TNFRSF17 auf Chromosom 16 lokalisiert)
  • Einschluss in klinische Studie zu CAR T-Zell Therapie mit BCMA als Zielantigen
  • Partielle Remission nach CAR-T-Zell Therapie, jedoch ca. 4 Monate nach Therapie fulminantes Rezidiv mit rasch steigendem Paraprotein

Hochrisiko-Erkrankung

WGS & WTS Ergebnisse

Indikation: genomischer Status TNFRSF17 zur Überprüfung einer Resistenz gegenüber BCMA-gerichteter Therapie

TNFRSF17 ?

WGS-Befund (Ganzgenomsequenzierung):

  • Mutationen (SNV): CYLD (Tier 1), KRAS (Tier 1), RB1 (Tier 1), TP53 (Tier 2)
  • Kopienzahlveränderungen (CNV) > 1 Mb: hyperhaploider Chromosomensatz mit Monosomien der Chromosomen 1, 2, 4, 5, 6, 10, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 20, 21 und 22, weitere CNV der Chromosomenregionen 1q, 3q, 7q, 8p und 15q
  • Kopienzahlveränderungen (CNV) < 1 Mb: 16p Deletion (homozygote TNFRSF17 Deletion)
  • Strukturelle Veränderungen (SV): SV der Chromosomen Y und 15, SV der Chromosomen 16 und 17, (GPATCH8::SNX29 Rearrangement)
Links ist der Coverage-Plot dargestellt, der die Kopienzahlveränderungen illustriert. In Kombination mit dem rechts abgebildeten BAF-Plot (Bi-Allel-Frequenz), erkennt man, dass ein Großteil der Chromosomen haploid vorliegt.

WTS-Befund (Transkriptomanalyse):

  • Fusionen: GPATCH8::SNX29
  • Expression: deutlich reduzierte TNFRSF17 Expression
Circos-Plot Darstellung des WGS-Befunds. Kopienzahlveränderungen sind in rot (Verlust) und hellblau (Zugewinn) dargestellt. Strukturelle Veränderungen sind durch rote Verbindungslinien gekennzeichnet.

Bedeutung für die Diagnose und/oder Therapie

Resistenzmechanismus bzw. Grund für das Therapieversagen der CAR T-Zell Therapie: Nachweis einer bi-allelischen TNFRSF17 Deletion und somit definitiver Ausschluss einer erneuten BCMA-gerichteten Therapieoption im weiteren Behandlungsverlauf

Ausschluss BCMA-gerichteter Therapie